Inaugurada em 1988, em instalações provisórias numa antiga fábrica da cidade de Setúbal, a Escola Secundária do Viso passou, no ano seguinte, para a localização atual. No ano 2000, tomou a denominação de Escola Secundária com 3º Ciclo do Ensino Básico Lima de Freitas, adotando para patrono o artista Lima de Freitas, num ato de reconhecimento público do valor da sua obra artística e da sua ação cultural.
Artista multifacetado, pintor, desenhador, gravador e ensaísta da problemática do imaginário da arte, o Mestre Lima de Freitas ocupa um lugar de relevo no panorama artístico português da segunda metade do século XX.
No ano letivo de 2006/07, o Agrupamento de Escolas foi constituído, tendo como escola sede a Escola Básica e Secundária Lima de Freitas, englobando duas escolas do 1.º ciclo (Escola Básica nº9 e Escola Básica do Viso), anteriormente associadas ao Agrupamento de Escolas Barbosa du Bocage. Nos anos de 2011 e 2012, a escola sede foi intervencionada, no âmbito da requalificação promovida pela empresa pública Parque Escolar, alterando qualitativamente os espaços escolares.
Atualmente o
Agrupamento de Escolas Lima de Freitas proporciona à sua população escolar uma oferta educativa que vai do pré-escolar até à educação de adultos. Funciona, também, no Agrupamento o Centro Qualifica Arrábida e o Centro de Formação Ordem de Santiago. A pluralidade da oferta educativa torna o agrupamento ímpar na região, contribuindo de uma forma significativa para a melhoria da formação da população que o procura.
O Agrupamento de Escolas Lima de Freitas está situado na União de Freguesias de Setúbal, uma das cinco freguesias do concelho. Localiza-se no limite oeste da cidade, contíguo ao Parque Natural da Serra da Arrábida.
Ao longo dos anos, tem sido preocupação do Agrupamento receber alunos provenientes de várias zonas da cidade, embora seja seu principal propósito acolher alunos que aí perfaçam todo o seu percurso escolar.
Atualmente, a população escolar deste Agrupamento integra alunos de áreas mais afastadas, apesar de a sua maioria ser proveniente dos bairros circundantes, onde persistem carências socioeconómicas e culturais, existindo um elevado número de alunos com apoio da Ação Social Escolar (ASE).
O Agrupamento dispõe de um corpo docente estável, conhecedor da realidade das suas escolas e dos constrangimentos associados, que trabalha com vista ao sucesso escolar e à formação de cidadãos, enquanto pessoas autónomas, responsáveis e participativas.
Tendo por base O Perfil do Aluno à Saída dos Ensinos Básico e Secundário, os docentes e outros colaboradores deste Agrupamento, valendo-se das suas qualidades científicas, éticas e profissionais, procuram promover o desenvolvimento integral dos seus alunos ao nível dos conhecimentos, capacidades e atitudes.